Puedes tener varios grupos de usuarios teniendo cada uno de ellos su directorio raiz, automatizando así todos los procesos. Por ejemplo, las siguiente líneas son las que contiene el archivo *.vfs (Sistema Virtual de Archivos):

C:\Directorio raiz del FTP\%g|/|me|admin|744|r|0|0|0|0|0|0|0|0|
C:\Archivos del FTP\musica|/music|me|root|744|r|0|0|0|0|0|0|0|0|
C:\Archivos del FTP\video|/video|me|root|744|r|0|0|0|0|0|0|0|0|
C:\Archivos del FTP\colegio|/school|me|root|744|r|0|0|0|0|0|0|0|0|

Por lo tanto la estructura de archivos quedaría de la siguiente manera:

C:\
|
+\Directorio raiz del FTP
| |
| +\grupo1
| | |
| | +\musica (vacío)
| | +\video (vacío)
| +\grupo2
| | |
| | +\musica (vacío)
| | +\video (vacío)
| | +\colegio (vacío)
| +\Cualquier otro grupo
|
+\musica (los archivos irían aquí)
+\video (los archivos irían aquí)
+\coelgio (los archivos irían aquí)

Todos los directorios que estén en blanco (vacios) en el grupo de directorios RAIZ (C:\Directorio raiz del FTP\grupo) serán los que los clientes vean. Los demás permanecerán ocultos.